Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lipo1J3QME6 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lipo1J3QME6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms