Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn34c3J3QJW5 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms