Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn20G5E8X0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Cldn20G5E8X0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn20G5E8X0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn20G5E8X0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn20G5E8X0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn20G5E8X0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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