Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms