Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm3543D3Z235 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm3543D3Z235 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm3543D3Z235 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm3543D3Z235 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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