Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms