Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prr29B1ARI9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 4933411G06Rik-201ENSMUST00000075909 1022 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 AC159886.1-201ENSMUST00000217099 1091 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr29B1ARI9 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Prr29B1ARI9 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 4930408K08Rik-201ENSMUST00000195936 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr29B1ARI9 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms