Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Skint5A7XUY5 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms