Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2-M5A7VMS3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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