Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
H2al1jA2BFR3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
H2al1jA2BFR3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms