Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Frmpd1A2AKB4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Frmpd1A2AKB4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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