Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Speer3W4VSP1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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