Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms