Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam50bQ9WTJ8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms