Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nek3Q9R0A5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nek3Q9R0A5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nek3Q9R0A5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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