Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AmfrQ9R049 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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AmfrQ9R049 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
AmfrQ9R049 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms