Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms