Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Higd1aQ9JLR9 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Higd1aQ9JLR9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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