Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gde1Q9JL56 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms