Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Ms4a4bQ9ES61 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms