Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Csnk1dQ9DC28 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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