Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc97Q9DBT3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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