Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SrpraQ9DBG7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms