Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
MsraQ9D6Y7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
MsraQ9D6Y7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms