Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc7Q9D541 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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Ccdc7Q9D541 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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