Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pabpc6Q9D4E6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms