Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gtf2e1Q9D0D5 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms