Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cnot11Q9CWN7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cnot11Q9CWN7 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms