Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rprd1bQ9CSU0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms