Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snw1Q9CSN1 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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