Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Q9CRC3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Q9CRC3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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