Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nicn1Q9CQM0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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