Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Ccer1Q9CQL2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccer1Q9CQL2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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