Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rdm1Q9CQK3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rdm1Q9CQK3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms