Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ndufb9Q9CQJ8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms