Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Higd2aQ9CQJ1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms