Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Smim3Q99PE5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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