Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SrrtQ99MR6 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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