Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Atp1b4Q99ME6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Atp1b4Q99ME6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms