Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Rcbtb2Q99LJ7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms