Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp16Q99LG0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms