Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmp1Q99KU0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms