Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
TrabdQ99JY4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
TrabdQ99JY4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms