Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cldn16Q925N4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
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