Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trim59Q922Y2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms