Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Med28Q920D3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Med28Q920D3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Med28Q920D3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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