Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp3Q91W36 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms