Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cabp4Q8VHC5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms