Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ttc39cQ8VE09 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ttc39cQ8VE09 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms