Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 806 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sgip1Q8VD37 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms